Como contribución al desarrollo y el fortalecimiento económico de las comunidades que habitan la zona de intervención del Proyecto, se implementa el programa de apoyo a la capacidad de gestión institucional, compuesto por líneas estratégicas y lineamientos metodológicos para la identificación y formulación de Proyectos e iniciativas productivas que beneficien a los pobladores del área de influencia.
El programa parte de la creación de 3 líneas estratégicas, que buscan contribuir al mejoramiento de la calidad de vida de los habitantes de la zona en alianza con las organizaciones comunitarias e institucionales, gestionando la cooperación interinstitucional, promoviendo convenios con entidades públicas y privadas y buscando la incorporación al desarrollo social y económico de la región.
Para lograr este objetivo, desde el programa se lideran actividades concernientes a la capacitación y empoderamiento de las organizaciones sociales, autoridades municipales y departamentales, buscando contribuir a crear mecanismos que les generen mayor autonomía y capacidad en el proceso de planificación regional y local, finalmente, a prevenir la invasión del espacio público alrededor del corredor vial, cuya responsabilidad legal está en manos de las administraciones municipales correspondientes.